Batch ABI/SCF Sequences Assembler 2.60

Licenza: Gratuito ‎Dimensioni del file: 1.32 MB
‎Valutazione utenti: 3.3/5 - ‎6 ‎Voti

Batch ABI/SCF Sequences Assembler è un software facile da usare per l'assemblaggio semplice e batch della sequenza di DNA, l'analisi della sequenza del DNA, l'editing di conti, l'integrazione dei metadati e il rilevamento delle mutazioni. Offre anche un potente visualizzatore / editor di cromatogrammi. L'interfaccia davvero intuitiva rende Batch ABI/SCF Sequences Assembler la scelta migliore per l'assemblaggio di contigui del DNA. Perché l'assemblatore di sequenze Batch ABI/SCF è speciale? Lo strumento di assemblaggio della sequenza offerto dal programma è completo. È possibile importare e allineare più sequenze di DNA a una sequenza di riferimento. I formati di input supportati sono: SCF, ABI, AB, AB1, AB!, FASTA, SEQ, GBK, TXT, multiFASTA. Il visualizzatore/ editor di cromatogrammi è davvero buono e facile da usare. Con un solo clic qualsiasi cromatogramma può essere integrato in senso inverso. Le ambiguità sono molto facili da individuare nel visualizzatore di assembly di sequenza perché sono chiaramente contrassegnate in rosso. Ci sono pulsanti di traino che ti consentono di passare all'ambiguità successiva / precedente. Le basi possono essere modificate/eliminate. Le estremità di bassa qualità non vengono prese in considerazione quando viene creato il contito e sono contrassegnate in colore grigio scuro. L'intero allineamento può essere visualizzato a colpo d'occhio nel visualizzatore della mappa contigua. http://www.dna-assembly.com

cronologia delle versioni

  • Versione 2.60 pubblicato il 2012-04-23
    Novità: integrazione di metadati e metadati batch. Novità: pulsante per aprire Esplora risorse nella cartella di Contig, dopo l'assembly di sequenza. Novità: rimuovere i vettori da singoli cromatogrammi. Novità: SEQUENCE ANALISYS - contrassegnare le basi con un livello di confidenza (QV) al di sotto di una soglia specificata, in rosso.

Dettagli del programma