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USeq 7.7.7
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Circa USeq
USeq è una raccolta di strumenti software per l'analisi sia di basso che di alto livello di dati di sequenziamento della firma ad altissima produttività di nuova generazione dalle piattaforme Solexa, SOLiD e 454. Enfasi iniziale: chIP-seq e RNA-Seq con stime FDR. USeq è in continuo sviluppo presso il Huntsman Cancer Institute nello Utah Bioinformatics Shared Resource Center. USeq ora utilizza il pacchetto DESeq R per calcolare i valori p da una distribuzione binomiale negativa per l'arricchimento/riduzione differenziale.