NDKmol -- Visualizzatore molecolare per Android == Note ==== Bibliografia ==== Altri progetti ==== Collegamenti esterni == NDKmol è un visualizzatore molecolare per Android. È possibile visualizzare strutture tridimensionali di proteine, acidi nucleici e piccole molecole. NDKmol supporta la maggior parte delle rappresentazioni comuni per molecole, come nastro, traccia, bastone, sfera e linea. NDKmol supporta anche operazioni di simmetria; possono essere visualizzati assemblaggi biologici e imballaggi in cristallo. È possibile cercare e scaricare strutture da RCSB PDB e NCBI Pubchem. NDKmol ha quasi la stessa funzionalità di GLmol, che è scritto in WebGL/Javascript ed è eseguito su browser Web. Puoi provare GLmol a http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html == Caratteristiche == * Leggere il file PDB o SDF/MOL * Ruota/Traduci/Zoom modello per dito * Rappresentazioni - Linea - Bastone - Sfera (raggio van der Waals) - Traccia di carbonio alfa - Nastro (sottile o spesso) - Filone - Tubo fattorino B - Scala dell'acido nucleico - Linea di acido nucleico - solventi «stelle» * Levigatura dei fogli beta * Colorazione - Per catena - Per struttura secondaria (se definita nei record SHEET/HELIX) - Per elementi - Gradazione (a.k.a chainbow) - Fattore B - polare/non polare * Cristallografia - Cella dell'unità video - Mostrare l'imballaggio del cristallo (quando definito nella sezione REMARK) - Visualizzare l'assemblaggio biologico (se definito nella sezione REMARK) == Come usare == Quando viene lanciato, NDKmol carica automaticamente Porin (PDBID: 2POR) come esempio. Puoi ruotare la molecola con il dito. Per ingrandire o tradurre la molecola, premere il tasto MENU nel telefono/tablet e selezionare la modalità. Sono supportati anche gesti con due dita. Tutto il resto può essere fatto dal MENU. Per caricare altri file PDB, inserire il file nella directory "PDB" della scheda SD e selezionare il comando "Apri" nel MENU. È inoltre possibile scaricare strutture direttamente dal server web RCSB PDB e NCBI PubChem. Selezionare "Cerca e scarica" nel menu. == Altri progetti ==== Collegamenti esterni ==* Sito ufficiale Il sito web del progetto si trova http://webglmol.sourceforge.jp/ . È possibile ottenere i codici sorgente per questo programma da qui. Commenti e suggerimenti sono i benvenuti http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ o [email protected] === Avviso DI LICENZA === NDKmol stesso è sotto licenza GNU Lesser General Public License come segue. Tuttavia, i file PDB inclusi come esempi si trovano in condizioni DIVERSE. Consultare http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Visualizzatore Molecolare per Android (C) Copyright 2011, biochem_fan Questo programma è software libero: è possibile ridistribuirlo e/o modificare sotto i termini della GNU Lesser General Public License come pubblicato da la Free Software Foundation, versione 3 della Licenza, o (a vostra scelta) qualsiasi versione successiva. Questo programma è distribuito nella speranza che sia utile, ma SENZA ALCUNA GARANZIA; senza nemmeno la garanzia implicita di COMMERCIABILITÀ O IDONEITÀ PER UNO SCOPO PARTICOLARE. Vedere la GNU Lesser General Public License per maggiori dettagli. Avrei dovuto ricevere una copia della GNU Lesser General Public License
cronologia delle versioni
- Versione 0.97 pubblicato il 2018-03-25
Download pdb fisso da RCSB PDB - Versione 0.95 pubblicato il 2015-05-02
Versione 0.95 (20150503),* Risolto "Cerca PubChem" per funzionare con il recente aggiornamento del server,* Si spera che questa versione funzioni su Android 5. (Testato in Android 5.1 su Nexus 7),In caso meno, inviami i dettagli.,* Può aprire i file di mappa MRC (BETA),Agli utenti di dispositivi senza pulsante MENU:,ci dovrebbe essere un modo per aprire MENU, ad esempio premendo, tasto HOME lungo. Si prega di consultare il manuale del dispositivo. - Versione 0.92 pubblicato il 2013-07-02
Diverse correzioni e aggiornamenti
Dettagli del programma
- Categoria: Istruzione > Strumenti didattici e di formazione
- Editore: biochem_fan
- Licenza: Gratuito
- Prezzo: N/A
- Versione: 0.97
- Piattaforma: android