RNA BASER Sequence Assembler 3.1

Licenza: Gratuito ‎Dimensioni del file: 1.34 MB
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www.DnaBaser.com Software di allineamento facile da usare per l'assemblaggio di conti di sequenza RNA, la modifica dei conti e il rilevamento delle mutazioni per Windows. È un software di biologia molecolare in grado di visualizzare e assemblare sequenze nei contig. Caratteristiche: clip finale, sequenze di esportazione, assembly, rilevamento del codice. Descrizione: RNA Baser è un'alternativa conveniente per l'assemblaggio di sequenze di RNA e la generazione di contig. I formati di file supportati sono abi, scf e seq (o FASTA). I cromatogrammi delle sequenze assemblate vengono visualizzati in un formato sincronizzato con il contiguo generato. Vengono evidenziate basi ambigue nel contig e le correzioni sono suggerite da DnaBaser in base ai valori di qualità dei file di traccia. Input minimo richiesto dall'utente. È possibile modificare basi ambigue, incluso l'inserimento e l'eliminazione. Le impostazioni del motore di assemblaggio possono essere regolate dall'utente. L'utente può personalizzare l'aspetto di cromatogrammi, nucleotidi, sfondo. I valori di qualità dei file di traccia vengono visualizzati sopra i cromatogrammi, in modo che l'utente possa facilmente decidere le correzioni nel contiguo finale. I file cromatogramma originali vengono tagliati automaticamente in base ai valori di qualità. Il contito viene salvato automaticamente in formato FASTA, nella stessa directory con i file di traccia originali. Utilizzando un database incorporato di sequenze primer e vettoriali, che può essere modificato / aggiornato dall'utente, DnaBaser può essere impostato per tagliare automaticamente la sequenza vettoriale dal contito finale. Descrizione: software di allineamento facile da usare per lo strumento di sequenziamento dell'RNA, la modifica dei conti e il rilevamento delle mutazioni per Windows. È un software di biologia molecolare in grado di visualizzare e assemblare sequenze nei contig. Caratteristiche: clip finale, sequenze di esportazione, assembly, rilevamento del codice. È un'alternativa di prezzo per l'assemblaggio di RNA contig. Scarica gli strumenti freeware per la conversione dei file. trim vector sequence free program align alignment base convert consensus sequence trace mac os x windows mutation primer, qualità pcr in tempo reale.

cronologia delle versioni

  • Versione 3.1 pubblicato il 2012-03-18
    Assieme di sequenza. Migliaia di contig possono essere assemblati contemporaneamente.

Dettagli del programma